于是，在梦奇制造的梦境里，地球少女再次见到了已故的首领，她没有将方舟核心送往太空，而是重启了核心……
最后，她也消失在方舟里。
“过程很精彩……虽然你现在知道的会改变，但是，这样才能活成自己，不是吗？”首领笑了一下。
她突然想起，自己已经不记得那笑容，在那些短暂的、醒着的时间里，都湮灭在过去。
“女娲写的故事是……你会与鬼谷子、梦奇通过娲皇殿的指令，找到妲己和鲁班七号，然后在长城之畔与长城小分队的相遇，和兰陵王一起阻止魔种攻城，从铠的记忆里，得知海都的诅咒和天书碎片的下落。”
首领念完，又道，“故事还凑合，如果让我来写你的命运，估计是让你直奔长安，搞定一切！”
“……追杀扁鹊时遇见庄周，回忆过去的自己…你的过去有什么可回忆的…天书碎片集齐一半，你带着一行人前往长安…啊，太浪费时间了！”
“你与老夫子解开姜子牙的封印，对女娲理念的动摇……不，我觉得你不会动摇。”
“梦奇找到李白，他是继承天书碎片的人……额，她连这个都想到了……你与尧天组织的接触，狄仁杰和李元芳查探到你的的身份，报告给女帝……如果这么简单就被探查到了，就别说是我的助手！”
“我明白的，首领……”
“虽然你看到的我是个知识投影，但是，我留下的这些话，永远不会改变！”
“G，十二奇迹并非我们的目标，你的任务，不过是我想要你四处旅行的借口…我已经没办法了，你还能活成自己。”
“我明白了，首领…”
遥远时光里，红眼面具下的眼睛缓缓闭上，再次睁眼时，那首领的知识投影，已经湮灭。
她说，“这个故事的结局……我看到了呀！”
……她唤醒方舟核心，与钟馗的谈话，方舟核心属于超智慧体，终有一天，首领会重新回到这个世界。
为了收集天书，少女一行人去六国旅行，中途为了女娲的计划，抛下队友迁跃到达勇士之地，重逢安琪拉。
于海都遇到即将前往长安的马可波罗，同样迁跃而来的鬼谷子等人，一同在海都找到天书碎片。
拿到碎片后，一行人前往北夷部部落，被成吉思汗追杀时，王昭君救了他们。
命中注定的人在长安，但她不愿离开极北之地。
一行人回到初遇的王者峡谷，向鬼谷子等人说出了她的计划，将首领复活。
但复活首领的同时，魔道生物一同醒来，鬼谷子等人死亡。
神明的因果，最后一同归于尘土，少女带着他们来到方舟核心，不惜一切代价想让他们复活。
在少女与方舟核心商量后，以将四人复活的条件，让核心前往太空与天眼结合。
与此同时，巡街的钟馗被李白伏击，马可波罗开启方舟，不久，阴谋被化解。
核心里，少女加快了复活他们的进程，但他们在得知了赫希送走核心的计划后，最后与她为敌。
她在设定了核心与天眼对接的航线后，以一己之力对抗所有前来阻止她的人，在梦奇的梦里走一遭后，她关闭了核心，而代价则是赫希与核心融合……
“你看啊首领，我没有经历那样的故事！”
一切都和方舟的安排相违背！