于是乎，威尔森、克连吉可和卡诺艾美三人一起坐地球联邦机构的时光机穿梭到了1989年，准备搞日本。
怎么个搞法呢？
这几个货也很有想法，穿越到1989年，再从1989年穿越到1944年的拉哥斯岛（你没看错，就是拉哥斯岛），这座岛上生活着一只恐龙（对，你没猜错，这货就是哥斯拉），二战结束后，美军在岛不远做核试验，核试验导致岛上的恐龙变成了哥斯拉。这几货的想法就是把恐龙搬走，换一个地方，恐龙就不会变成哥斯拉，再把三只来自未来的小宠物扔在岛上，代替恐龙接受核辐射变异。
计划是成功的！当几人再回到1989时，发现哥斯拉已经消失了，但出现了一只新的怪物，基多拉（就是那几只未来宠物变的）。
基多拉受到威尔森和克连吉可操控，在日本大肆破坏，每天炸炸这里，坑坑那儿，把日本搞成了一团浆糊。
这时候，见到日本这个惨样，未来人中那个叫卡诺艾美的女人反水了，前面也说过这货是个日裔，还十分爱国。所以反起水来毫不留情，坑死基多拉，做死了两名未来人队友。
丫的又发现，在白令海峡变异的哥斯拉又干不掉了，于是再穿回23世纪，用23世纪的科技复活了基多拉，还给它按了个机械龙头，又再穿回1989年，怼翻了哥斯拉，将哥斯拉沉进了大海中（实在不明白，废这么大劲，最后为什么不宰了哥斯拉？）。
这电影里有很多问题，不可深究，比如改变了时空后，几人的记忆就是一个明显的bug。
既然你们改变了时空，不存在哥斯拉，那也就不会有关于哥斯拉的记忆，可电影里几个人还是有记忆，还知道哥斯拉是什么。
这部哥斯拉电影为什么叫“魔龙复仇”呢？
其实就是电影前面提到的，基多拉在20世纪末被哥斯拉击败，坠落到海中，未来人穿越时空，将它再造出来，与哥斯拉又打了两架，最后一次成功怼翻哥斯拉，复仇成功的意思。