火影办公室，宇智波鼬报告，“宇智波止水是宇智波一族中年轻人的中坚力量，他的自杀使得宇智波的士气和战斗力瞬间下降。”转寝小春道，“就结果而言，还是扼杀了叛乱的萌芽啊”猿飞心痛不已，“难道止水也只能用自杀的方式来阻止他们吗是不是我把他逼得太紧了呢”团藏还在装好人，其实他的右眼已经换上了止水的写轮眼，“貌似宇智波一族之中，有人是怀疑你杀了止水。”
鼬道，“我和止水一样，所做的一切都是为了宇智波。只有不明白这一点的人，才会说出这样的话。止水没有出现在汇合地点”鼬是在警告团藏，团藏也害怕事情败露，“因为隐藏的秘密受到怀疑吗让暗部正式传达止水自杀的消息吧没问题吧，猿飞”猿飞同意了，他只是觉得事情有些蹊跷。
晚上，南贺神社，宇智波鼬来到这里，再次观看了祖传的石碑。现在拥有万花筒写轮眼，他看到了更多的内容。
宇智波鼬继续在暗部的生涯，某个夜晚，卡卡西带领第六班的暗部忍者，与一群潜入森林的草忍进行了我知道，和这有关吗”鼬道，“不，没什么。”卡卡西道，“虽然帮不上太多的忙，但如果遇到什么难题，尽管开口。”鼬答应。
南贺河，宇智波鼬来到这里吊祭止水，“止水，自那之后，情况变得更加恶劣了。村子和宇智波我都保护不了啊”
宇智波鼬加入暗部大约1年多了，木叶高层召见卡卡西与鼬。团藏道，“随着任务增加，现在决定增设暗部班，队长就由鼬来担任。”鼬应诺。小春道，“我不反对，不过你真年轻啊几岁了”鼬道，“13岁。”团藏道，“有人成为上忍的时候，比他还年轻呢”团藏说的是卡卡西。门炎道，“进暗部两年就当上队长了啊”小春道，“是暗部队长里最年轻的一个吧”团藏道，“新班的队员，由我的暗部出人。”从始至终，猿飞都没有说话，他的心情很沉重。
离开火影办公室，卡卡西道，“你将被调去团藏的暗部。”鼬道，“大概吧”卡卡西提醒，“别被卷入上层的政治斗争里。”鼬喊住要走的卡卡西，说了类似诀别的话，“这两年承蒙关照了”卡卡西道，“你只是换个部门而已，照样还是木叶忍者，又不是要离开这里。”
第三演习场，大和道，“他才13岁，真让他担任暗部队长吗”卡卡西道，“毕竟他不是普通的忍者。”大和道，“即便拥有写轮眼，13岁担任队长也是破格提拔了。”而顶替宇智波鼬补入第六班的人就是疾风的恋人卯月夕颜。
虽然止水死亡，但宇智波一族叛变的步伐并没有停下来。宇智波富岳召见了族中的中上忍，看着黑压压一片的高级忍者，富岳很满意，“希望你们能服从命令”众人一起应诺。富岳表情严肃，他知道这次政变成功的几率不大，但事到如今，也只好铤而走险了。
十三岁的宇智波鼬被任命为暗部的队长，而实质上是团藏想要纳为己用，鼬继续向团藏透漏着宇智波家族的情况。宇智波鼬面见团藏，团藏道，“我收到报告，警备队正在强化武装。这究竟是什么意思”鼬道，“宇智波对村子的不满再次升级了。”团藏道，“不能再这样下去了。”
火影办公室，卡卡西参见火影，宽袍大袖的结界班班长卡柯伊也在那里。猿飞道，“木叶的结界系统你应该知道吧”卡卡西道，“就是那个能感知擅自入侵村子的人的系统吧”猿飞道，“似乎有人突破了结界，几次三番地进入村子。”结界班长卡柯伊道，“穿过结界的暗号术式，在木叶只有一小部分人知道，可能是叛徒泄露了信息。或者存在有能力解开结界术式的忍者。”
猿飞道，“如果是叛徒，可以通过改变术式来排查。但我更愿意相信有忍者能穿过结界，虽然我也不想承认。我要你去调查这件事”结界班长卡柯伊将部分结界配置图交给了卡卡西，“有些地区的反应频率很高。”其中反应频率高的地区就是宇智波的地区周边。卡柯伊道，“如果可以，我们也想在那边设置结界系统。但那里是他们的自治区，所以没法出手。”猿飞道，“行动时注意，别让人发现是暗部在进行调查。”
宇智波区的庭院，漩涡闪动，阿飞出现在那里，他戴着橘红色夹杂黑色条纹面具，穿着黑色长袍。阿飞察觉有异，急忙空间瞬移消失。树后，宇智波鼬戴着暗部面具出现。鼬非常细心，他对这个人的身份和能力感到十分震惊。
忍者学校，阿凯在远处观察那些学生。鸣人正在向佐助挑衅，“听着，我绝不会输给你这种人的”佐助没好气，“吊车尾一边吵吵去”两人话不投机，吵成一团。晶臧苦着脸在二人中间劝解。阿凯看得直摇头，卡卡西走过来，“你怎么在这里这时候来学校做什么”阿凯道，“是这样，我成了指导上忍。”卡卡西忍住笑，“你当下忍的老师”阿凯道，“是啊但说实话，我很不放心。不知道会负责什么样的学生。”
学校操场，鸣人甩开晶臧，冲向佐助，“你别在那装模作样了，臭屁佐助”佐助纵身一跃，躲开鸣人的偷袭，“你怎么那么烦人啊”鸣人跳脚，“闭嘴”晶臧拼命从后面抱住鸣人，“笨蛋鸣人，不能打架啊伊鲁卡老师刚刚才处罚完”鸣人大喊大叫，“放开我，晶臧我要教训他”
阿凯干笑两声，“这种学生的话，可能会很辛苦啊”卡卡西摇头，